Исполнительным органом управления Ассоциации является Исполнительная дирекция, которая выполняет решения Общего собрания, Совета, осуществляет ведение реестра (базы данных) членов Ассоциации в соответствии с правилами его ведения, путем внесения в реестр сведений о членах Ассоциации; планирует проведение мероприятий Ассоциации, осуществляет контроль их проведения; организует работу комитетов, комиссий и рабочих групп Ассоциации.

Основные функции и задачи Исполнительной дирекции определены в Уставе и конкретизированы в Положении, утвержденном решением Общего собрания.

Руководителем Исполнительной дирекции является Генеральный директор, который назначается на должность Советом Партнерства сроком на 5 (пять) лет и подотчетен ему.